Un 4 de agosto del año 1496 el adelantado Bartolomé Colón, primer gobernador y hermano del almirante Cristóbal Colón, descubridor de América, funda la ciudad de Santo Domingo.
En sus inicios esta ciudad recibió el nombre de Villa Nueva Isabela. Según la tradición oral recogida por los Cronistas de Indias, la ciudad de Santo Domingo fue fundada por órdenes del almirante Cristóbal Colón luego de que fuera trasladada la primera ciudadela del Nuevo Mundo que fue erigida en la costa Norte, en la provincia de Puerto Plata.
El 4 de agosto de 1496, cuando Bartolomé Colón colocó la primera piedra de la ciudad la bautizó con el nombre de Nueva Isabela, en honor a Isabel la Católica, la reina protectora de la expedición de Cristóbal Colón.
Más tarde el nombre de Nueva Isabela, fue sustituido por el de Santo Domingo de Guzmán, en honor al Santo del mismo nombre, según una versión de la época.